Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms