Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNIKQ9UKE5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNIKQ9UKE5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms