Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBE1Q9UJT0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms