Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NLKQ9UBE8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms