Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP35Q9P2H5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
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