Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKDREJQ9NTG1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms