Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPMQ9NSP4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms