Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLSTN2Q9H4D0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLSTN2Q9H4D0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms