Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA4CQ9C0C4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms