Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PUS3Q9BZE2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PUS3Q9BZE2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms