Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SNHG12Q9BXW3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms