Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MTA3Q9BTC8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms