Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYD88Q99836 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms