Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYCBPQ99417 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms