Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHF12Q96QT6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms