Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC43Q96MW1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms