Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP44Q96MT7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms