Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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