Protein–RNA interactions for Protein: Q96FH0

BORCS8, BLOC-1-related complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS8Q96FH0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS8Q96FH0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms