Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C11orf40Q8WZ69 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C11orf40Q8WZ69 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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