Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE23Q8NDY6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE23Q8NDY6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms