Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NLGN4XQ8N0W4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms