Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKAP1Q86WV1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms