Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM88Q6PEY1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM88Q6PEY1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms