Protein–RNA interactions for Protein: Q6P461

ACSM6, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM6Q6P461 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACSM6Q6P461 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms