Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
REEP3Q6NUK4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP3Q6NUK4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms