Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C10orf55Q5SWW7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms