Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDLIM3Q53GG5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDLIM3Q53GG5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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