Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UVSSAQ2YD98 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms