Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYSND1Q2T9J0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms