Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KNOP1Q1ED39 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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