Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSX1Q16384 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSX1Q16384 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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