Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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CYTH1Q15438 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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CYTH1Q15438 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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CYTH1Q15438 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CYTH1Q15438 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYTH1Q15438 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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