Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEC23BQ15437 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC23BQ15437 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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