Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms