Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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COL9A2Q14055 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COL9A2Q14055 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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