Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP1Q13835 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP1Q13835 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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