Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
SHROOM2Q13796 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SHROOM2Q13796 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
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