Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD4Q12950 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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