Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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EFEMP1Q12805 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFEMP1Q12805 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
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