Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP1Q04837 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms