Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms