Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK6Q00534 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms