Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXC5Q00444 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms