Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEFA1P59665 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms