Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB25P57735 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB25P57735 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB25P57735 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB25P57735 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms