Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGM4P49221 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGM4P49221 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGM4P49221 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TGM4P49221 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TGM4P49221 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms