Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP5P45974 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP5P45974 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP5P45974 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP5P45974 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP5P45974 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP5P45974 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms