Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2IP36954 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms