Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAMP1P23763 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms